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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

韩国籍机长的中国年：“忙并快乐着”******

　　(新春见闻)韩国籍机长的中国年：“忙并快乐着”

　　中新社重庆1月21日电 题：韩国籍机长的中国年：“忙并快乐着”

　　作者 张旭

　　19日晚间，完成2023年春运第14趟飞行，随后从河南郑州坐飞机返回重庆，抵渝已是20日凌晨；21日陪妻子、女儿吃火锅团聚，稍作休整；预计22日从重庆起飞，驾驶飞机前往上海……这个春节，韩国籍机长李汉英忙得“马不停蹄”。

　　作为一名服务中国春运的机长，李汉英来自韩国日山，现就职于西部航空有限责任公司。2023年春运是中国对新冠病毒感染实施“乙类乙管”后的首个春运，也是他在中国民航服务民众的第五个春运。

　　“来中国前，我服务过韩国‘春运’。”李汉英说，韩国民众在圣诞节至中国农历新年期间，会选择出国游，是为韩国“春运”；作为一名成熟机长，他驾驶过波音747、波音767、空客320等机型，多为国际航班，也多在这段时间迎来航班的热闹非凡。

　　2023年春运，中国民航迎来旅客量大幅增长，作为中国民航的一员，他用“忙并快乐着”形容自己的春运状态。

　　“韩国和中国都有‘春运’，两国其他文化也很相近，在中国工作、生活很舒服。”李汉英称，因看好中国民航，他选择来这里发展。这里距离他的家乡近，以他居住时间最长的重庆为例，约三小时航程，便于照顾家人。他还把女儿接来中国，上了国际学校，学习中文和英文，李汉英认为，这两门语言将成为与世界交流的重要语言工具。

　　李汉英知道，春节是中国人最重要的节日之一。在这几天，公司的外籍机长都会主动要求排班，好让中国籍同事有机会和家人团聚。往年间，绝大多数除夕和大年初一，他都手握操纵杆，往返各大城市，完成起飞、翱翔和降落。“在特别的日子，那种送乘客回家团聚的感觉，还挺有成就感。”李汉英说。

　　21日是中国农历除夕，这一天的团聚，也是李汉英一家三口在中国的首次除夕团聚。李汉英说，根据老家的习俗，大人要给小孩发红包，城市还有焰火表演等。听说重庆此次春节期间将进行焰火表演，李汉英非常期待。

　　“吃什么”自然是除夕团聚的重要议题。当地特色的麻辣火锅，毫无疑义地成为这个在渝韩国家庭的首选。“我的妻子和女儿，对重庆火锅有天然好感，第一次吃就深深爱上，尤其爱吃‘特辣’。”李汉英说，重庆人的热情，就像火锅一样吸引、温暖着他们，伴着他们消除远离家乡的孤独。

　　值得一提的是，一家三口还一起办理了中国“绿卡”(外国人永久居留身份证)。“这让我们在住酒店、过海关等，手续更简便。”李汉英说，他还听说“绿卡”在购买医疗保险方面有便利，打算忙完这个春运，和家人一起前去了解、办理。(完)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）